福州地区维管束木本植物，据福建师范大学生物系调查统计，共有109科、428属、945种及亚变种，约占全省木本植物总种数(1900余种)的48%，种类不少，但资源量不大。用材林面积只有3400平方公里，仅占全市土地总面积的28.41%；林分蓄积量1380.5万立方米，仅占全省(32169万立方米)的4.29%，森林覆盖率38.5%，低于全省平均水平。在树种结构上，针叶林明显多于阔叶林，两者大致为75∶25。针叶树中以马尾松和杉木为主，其中马尾松尤为突出。阔叶树中以壳斗科为主，如米槠、苦槠、甜槠、栲等，其次为樟科，如樟、楠等。桑科榕树分布也较普遍。
　　(一)主要树种
　　马尾松　松科，松属，常绿针叶树，是福州地区分布最广，数量最多的树种。遍布全市海拔800米以下的山地、丘陵、台地、面积达2146.52平方公里，占全市用材林面积的63.1%。喜光、耐瘠、耐旱，是荒山造林的先锋树种。马尾松纹理直，有弹性，可供建筑、薪材及造纸用。树干及根枝可提炼松香和松节油，还能培养茯苓、蕈类，作中药用。
　　杉木　杉科，常绿针叶树，多为人工营造。主要分布于闽清、永泰、闽侯海拔400～700米的山地，面积485.25平方公里，占全市用材林面积的14.3%。杉木对土壤、气候要求较高，最适宜在肥沃、深厚、疏松、排水良好的土壤及日照短、湿度大、温差小、风力弱的山洼、谷地和阴坡生长，25年左右即可成材。材质轻韧、强度适中，质量系数高，含有“杉脑”，具香味，能抗虫耐腐，是优良的建筑、桥梁、造船和家具用材。
　　米槠　壳斗科，栲属，为常绿阔叶林的优势种或建群种。分布于海拔1000米以下的山地、丘陵，以永泰、闽清两县数量最多、也见于鼓山涌泉寺周围林中。木材坚硬，抗压力强，耐水湿，为建筑良材。坚果种仁富含淀粉，可食用或酿酒，也是木本油料树种之一。
　　樟树　樟科，樟属，常绿阔叶树，为亚热带常绿阔叶林优势树种和珍贵树种。含有挥发油和特殊香气，耐腐抗虫。多生长于湿润、肥沃的土壤中，福州地区分布广泛，但都杂生于阔叶林中，成片的很少。材质优良，是珍贵的造船、家具、建筑和雕刻用材。根、干、枝、叶可提制樟脑和樟油。
　　榕　属桑科，为常绿大乔木。1985年市人大常委会定为市树。福州别称“榕城”。干生气根，下垂，长而入土，粗如支柱。叶深绿色，卵形。木材红褐色，轻软，纹理不均。各地多有榕树，常为大树或古树。
　　玉兰　木兰科，木兰属。为绿化观赏树种，主要作为园林绿化树或行道树，在福州市城镇栽植普遍。性喜光，喜暖热湿润气候和肥沃、深厚、排水良好的酸性至中性土壤。树形高大优美，叶青翠碧绿，花洁白如玉，香气四溢。花蕾可入药，花可制取浸膏。材质优良，可作家具。玉兰对二氧化硫、氯气等有抗性、是良好的净化废气树种。
　　木麻黄　木麻黄科，木麻黄属，是优良的防风固沙常绿树种，在福州沿海地区有广泛分布。喜光和干热气候，具有耐干、耐瘠、耐盐碱、抗风等功能。1960年在平潭引种后，发展很快，已成为沿海防护林系中最主要的树种。木麻黄树冠优美，可作为庭园绿化树种。
　　台湾相思树　含羞草科，合欢属，常绿乔木。主要分布在平潭、福清、长乐等沿海的丘陵、台地。喜光、喜暖、耐旱、耐瘠，在冲刷严重的酸性粗骨土、砂质土和粘质土均能生长。根深材韧、抗风力强，根系发达，具根瘤，并有很强的萌发力，是良好的薪材和防风固沙树种。
　　(二)古树和珍稀树
　　福州地区虽然多为次生植被，但仍保存有相当数量的古树、大树和珍稀树种。
　　古榕树　福州现存的榕树最古的是市区朱紫坊河畔的“龙墙榕”，植于唐天复元年(901年)，裸根形成一堵墙，宛如蟠龙腾跃，颇为壮观。最大的榕树在省府路轻工厅大院内，共有6株，其中1株胸径为13.5米，高26米，冠幅460平方米，树龄千年。最奇的榕树是在西门高峰桥边，植于清乾隆五年(1740米)，该树的一条气根长入对岸土中，成为粗壮的树干，一树两根，宛如“人”字，船只就从“人字榕”下驶过。乌石山的榕树林，互相紧扭在一起，分不清主干和肢体。树根攀援在岩石上或插入岩隙中，犹如精心编织的鱼网，颇具艺术价值。
　　古樟树　福州郊区怀安乡有1株千年树龄古樟，人称“樟树王”。该树生长在怀安小学体育场边，树干14个成人始能合抱。高20米，冠幅直径25米，可惜此树于1970年被当地人砍伐用于造船。五一路古仙小游园内一株古樟，胸往3.14米，高20米，冠幅300平方米，树龄达500余年。
　　古荔枝树　西禅寺原有唐代古荔枝1株，已于“文化大革命”中枯死。现法堂前右侧有1株宋代荔枝，树干大部已朽，但仍有少量枝叶，但不能产果。郊区盖山乡下濂村浦尾1株古荔，胸径1.2米，高10米，冠幅直径14米，树龄已数百年，至今仍能产果。
　　古龙眼树　全市最大龙眼树在郊区建新乡怀安北端江边，外号“四叉伯”，胸径1.17米，高8.5米，分四大支干，冠幅直径13米，树龄500多年，历史上最高年产量800公斤，近几年产150～200公斤，品种奇特，红核二元。
　　白玉兰　盖山乡妙峰山下有1株白玉兰，胸径1.7米，高13米，冠幅直径18米，每年产春花220多公斤，秋花100多公斤。
　　古苏铁　鼓山涌泉寺圣箭堂有3株苏铁(亦称铁树)，相联成列，左右2株特别粗大，属雌性，每年均能开花，花序生于茎部成大球果状；中间一株属雄性，花序近圆柱形，长可达40厘米。树龄均有数百年。建新乡政府院内3株铁树和西湖公园芳沁园1株铁树，已均有数百年历史。
　　古贝壳杉　仓山区福建省军区第六干休所内1株贝壳杉，胸径近1米，高3.3米，冠幅8平方米，为国内罕见，列为市文物保护单位。
　　古油杉　为国家二级保护植物，模式标本在鼓山涌泉寺。福州大学门口有3株油杉，其中1株胸径0.9米，高20米，冠幅10平方米。八一水库后山有1株俗称“油杉王”，胸径1.1米，高20米，冠幅达12米。南台岛上淮安村将军山(海拔100余米)，有成片油杉林，高度多在5～8米之间，最高约10米，属次生林性质。
　　毕氏南洋杉　在福建师范大学生物系院内有2株，1株胸径1.2米，高35米；另1株胸径0.7米，高30米。福州市区光禄坊省高级法院1株，胸径1.5米，高23米，冠幅64平方米。鼓楼区九彩小学内亦有1株，高22米。以上4株树龄均有100多年。
　　桂花　福州郊区亭江闽安村小学后院，有1株宋末种的金桂，高10米，树龄900余年，今犹枝叶扶苏，生机盎然。
　　水松　杉科，水松属，国家二级保护植物，只零星分布在永泰、闽清的林中湿地或河流两岸。
　　银杏　福州市区南台岛福州高级中学后大门石厝有1株银杏，胸径0.92米，高15米，冠幅直径12米。鼓楼区灵响路省电影公司宿舍院内的1株银杏，高22米。属国家二级保护植物。
　　福建柏　国家二级保护植物。永泰县嵩口镇大喜村山区有小片天然纯林；闽清金沙和罗源霍口的常绿阔叶林中有零星分布。
　　柳杉　鼓岭原有一片大柳杉林，计有2000多株，现尚存100多株，大的43株，其中1株树龄达千年，胸径3.2米，树高25.5米，冠幅直径20米。
　　杨梅　南台岛上淮安村后山有一片杨梅林，一般高10～13米，90%是已结果的雌株。其中最大1株高15米，胸径55.7厘米，从离地面1.5米处分出四叉，最大一叉直径达40.3厘米，其余三叉直径分别为35.5厘米、30.5厘米、31.8厘米，这四叉又分别再分为2～3小叉，堪称“杨梅王”。