清同治元年(1862年)，英国差会派教士马丁来古田，先在西区三保、雪地、巴斗、安洋等乡村传教，后入城关，在三保建萃贤堂，新义山建萃圣堂。同治二年，美国差会派教士麦利和、薛承恩来古田，先在三保、五保租室传教，后在五保建福华堂，二保建福音堂。同治四年，经省美部会、公理会安立间、美以美、长老会、伦敦会等6公会协商，古田、屏南两县划归安立间、美以美及美部会传教地区。从此，英属安立间，美属美以美两会在古田、屏南先后设立教堂。同治年间设7所，光绪年间设44所，宣统年间设2所，民国时期设16所，圣公会另设6个布道所(光绪年间4所，民国时期2所)，合计75所。在屏南境内设教堂9所，总计84所。光绪年间，两会先后在境内创办学校、医院，为传教场所。鸦片战争以来，古田人民对外国传教士愤懑难抑，终至光绪二十一年(1895年)爆发华山教案。
　　民国之初，第一次世界大战爆发，英美差会经济来源中断，境内教徒就有自立的愿望。民国24年(1935年)至民国27年，美以美公会教徒陈新恩、牧师蔡国旺等先后脱离原公会组织，在城关油巷口、迎仙桥另建教堂2所，安息会在凤都、渭洋、利洋等村设点布道。
　　1953年，古田各公会联合起来开展自立、自养、自传爱国运动，成立古田县基督教三自革新爱国委员会。“文化大革命”期间，教堂被封闭，器具资料被抄没，教牧人员受冲击审查，有的被遣散，三自会亦停止活动。1978年后，重新落实宗教政策，三自会恢复，教堂陆续开放，教徒又开展正常的信仰活动。
　　堂会　安立间公会后改名中华圣公会。光绪九年，县设支议，选议长主持工作，辖属省议会，会址在县城三保萃贤堂。全县设7个牧区(内含屏南牧区，由牧师主管。分管57所教堂及6个布道所)。
　　美以美公会后改卫理公会。光绪元年，县设连环司，与福州分立，管理古田、屏南、闽侯循环工作。光绪二十六年分设丘地连环司。宣统元年(1909年)，改名古屏连环司，民国3年丘地归古屏连环。逾两年在县城二保福音堂建连环司屋，负责全县19个牧区及城关福华、福音和大墘、横坑两村教堂。各牧区派牧师主持工作，分管全县暨屏南27所教堂。民国8年，屏(南)(平)湖牧区设连环司，再改设教区，地点均在平湖程厝里。
　　民国时期，各公会有教徒3765人。解放后，在中共古田县委统战部、人民政府宗教局领导下，信仰活动由三自会组织安排。1958年各公会在城关及郊区6所教堂及住房，属古田溪水库淹没区，政府拨款8.61万元，在新城胜利街重建萃贤堂。在建设路建简易教堂1所及三自楼、职工宿舍，在解放路建诊所店屋。1986年，政府拨款19.53万元，改建简易教堂、三自楼及宿舍。至1990年全县被批准开放的堂会34所，各堂会信众7000余人。