境内珍贵鱼类有鳗鲡、花鳗鲡、胭脂鱼、鲶、鳜、鲈鱼等6种，其中花鳗鲡和胭脂鱼属国家二级保护动物。经济鱼类有草鱼、鲫鱼、鲤鱼、黄颡、鳜、大眼鳜、鳗鲡、鲶、鮠、鲴、鳡、赤眼鳟等30种。其中鲤科鱼类是主要的渔猎对象。有的种类，如鳗鲡、鲶、鳜等，虽捕捞量有限，但因其肉味鲜美，营养丰富，有较高的经济价值。1978年后，草鱼、鲢鱼、胡子鲶等经济鱼类形成一定规模的养殖业，年产量达千余吨。
　　鲤鲡［AnguillaTemmcucketschlegel］　属鳗鲡科。俗称河鳗，旧志中称之“芦鳗”，能靠粘液上山，潜在山坑芦草中觅食。鳗鲡性凶猛，善袭击鱼群。大者重达10～20千克。属降河入海产卵的洄游鱼类，成体零星分布于闽江中上游一带，现数量稀少。鳗鲡肉质鲜嫩，胶质蛋白含量多，营养价值高，系鱼中珍品，市价昂贵，仅作滋补食物与筵席佳肴。
　　花鳗鲡［A．mauritiana］　属鳗鲡科。俗称花鳗，属国家二级保护动物。其生活习性与鳗鲡相同，外形区别主要是：花鳗的躯背及鳍布满不规则的灰黑色斑块。该鱼现甚罕见，属珍稀濒危品种。
　　胭脂鱼［Myxocyprinousasiaticus］　属胭脂鱼科。俗称雷公鱼，体形侧扁，背鳍长而高，头小，口唇肥厚，向外翻出呈吸盘状。成体雌鱼淡红鲜艳，呈胭脂色，故名。该鱼广泛分布于闽江中上游，产卵场在建瓯附近河段。建溪、富屯溪颇为常见，大者可达20～30千克。现属珍稀濒危种。市水产部门仅于1974年在湖尾坝下捕获一只7～8千克重的胭脂鱼。
　　鲤鱼［Cyprihuscarpio］　鲤科，简称鲤，是江河湖泊中常见的经济鱼类。1983年底，青州造纸厂排放污水，江面毒死的鱼群中，鲤鱼甚多，大者可达10～20千克。民间传说唐朝皇帝(李氏与鲤同音)，禁食鲤鱼，并将其神化。此后，活鲤常作放生鱼。南平亦有此遗风。鲤鱼市价不及草鱼，养殖发展缓慢，仅见少量混养。稻田养鲤仍处试养阶段
　　鲫鱼［Carassiusauratus］　属鲤科，简称鲫，广泛分布于江河库湾。群体产量高，是天然鱼产的优势种。常见体重100～150克，重者达1千克。肉嫩味美，倍受大众青睐。民国版《南平县志》记载：“剑潭所产荷包鲫，大而肥美”。家养鲫，鱼苗采自天然溪河中，与其它家鱼混养，生长较慢。20世纪80年代后，从广东等地引进银鲫和非洲鲫鱼，但发展缓慢。
　　草鱼［Ctenopharyugodonidellus］　鲤科，简称草，中名为鲩。江河常见的大型经济鱼，体重2～3千克，最大者可达30千克。因过量捕捞，现大者罕见。草鱼是南平主要的养殖鱼种。夏道镇徐洋、吴坍村，大横乡大仁州和峡阳镇大埂村均有100多年的养殖史。该鱼苗采自江河天然幼鱼，50年代多从江西、广东调进。1965年徐洋村人工繁殖草鱼成功，开始自繁自养。1988年，东坑乡际头村鱼种场开始供应家养草鱼苗，不足部分由建瓯、顺昌调进补充。草鱼发展快，经济效益高，市场需求量大。
　　鲢鱼［HypophthaLmichthysmolitrix］　属鲤科，常见的大型经济鱼类。普遍与草鱼混养。体重一般为2～3千克，最大者30多千克，现市售多在1千克左右，市场需求量远少于草鱼。
　　鳙鱼［Aristichthysnobilis］　属鲤科，俗称花鲢。常见的大型经济鱼类，多为3～4千克重，最大者可达40多千克。鲢、鳙鱼家养情况同草鱼，地产不能自给，多由建瓯，顺昌等贩进。贩者将鱼头尾缚紧，泡于水中，处休克状，称之弓鱼。
　　鲮鱼［Cirrhinusmolitorella］　属鲤科。俗称雪鱼，腹部银白色，畏寒，闽江上游少见，每遇大雪，冻死的鲮鱼漂浮于江面，渔民称之为“吃雪”。
　　鳡［Elopichthysbambusa］　属鲤科。俗称溪条，旧志中的“竹鱼”。鳡体圆长，状似竹筒，故名。性凶猛，常袭击捕食小型鱼群。常见5～10千克，大者可达50千克。该鱼肉质鲜嫩，脂肪丰富，为上等经济鱼类，倍受欢迎。80年代后，少见大鳡。
　　赤眼鳟［SpualiokarbusCurriculus］　属鲤科，俗称红目鲀，本地优势种，为主要捕涝的经济鱼。
　　刺鲃［BarbodesCaldwelli］　属鲤科，俗称溪，常见1千克左右，大者可达5千克，肉质肥厚，味鲜美。分布广，产量高，是溪河鱼群中的优势种。
　　团头鲂［MegaLobramaamblycephala］　属鲤科，亦称武昌鱼。70年代从长江流域引进，与家鱼混养，试养成功，重者可达1～2千克。肉嫩味美，宴客佳肴。
　　日本大阪鲫(CuvieriTemmincketSchlegel］　属鲤科，亦称日本白鲫、银鲫。80年代引进试养，推广缓慢。
　　鲤科鱼类还有：三角鲂(三角鳊)、台湾铲颌鱼(苦威)、东方墨头鱼(溪猪母)、半刺厚唇鱼(石板)　温洲厚唇鱼(花石斑)、福建棒花鱼(沙糠)、麦穗鱼(乌噜噜)、华鳈(花面鲫)、福建华鳈、似鮈(沙条)、点纹颌须鮈、银色颌须鮈、吻鮈(铁丁鱼)、花□(钩嘴)、蛇鮈(沙条)、海南鳅蛇、大眼鱲、大鳞鱲、宽鳍鱲鳃(花斑)、南方马口鱼(独霸)、大眼华鳊(大眼眶)、油□条(土条)、□条(苦条仔)、南方拟□、(青鱼条)、金华拟□、翘嘴红鲌(巴刀)、红鳍鲌(驼背巴刀)、银飘鱼(剃刀条)、寡鳞飘鱼、银鲴(黄尾)、细鳞斜颌鲴(青尾)、圆吻鲴(溪勒)、扁圆吻鲴(溪勒)、越南刺螃鮍、高体鰟皱等共计46种中、小型经济鱼类和生态鱼群。
　　纵纹原缨口鳅［VarmanchiaCalwelli］　属平鳍鳅科，有斑纹缨口鳅、拟腹吸鳅等3种。皆为常见的小型生态鱼群，个体小，数量多，渔民多捞之喂饲家禽，亦可食用。
　　泥鳅［Misgarnusahguillicaudaeus］　鳅科，俗称胡溜，多见于稻田、池塘。其肉质细嫩，骨刺酥软，营养价值高，亦可药用。80年代后，农田增施化肥农药，泥鳅数量锐减。该科还有紫薄鳅、扁尾薄鳅等2种，统称为“河鳅”，常见于各溪河水渠中。市售“胡溜”多从江西贩进的人工饲养品种，较之当地泥鳅体大，骨刺硬。
　　黄颡鱼［P．fulvidraco］　鲍科，别名黄鮟。该科境内发现有：江黄颡鱼、长尾鮠鱼、粗唇鲍鱼、白边鮠鱼等5种，民间统称为“黄甲”与“黄甲仔”。无鳞，肉味鲜美。为常见的经济鱼类，大者少见，市售10～13厘米长的“黄甲仔”占据鱼市，终年不衰，价格甚贵，多作小儿滋补食品。
　　鲶［Silurusasotus］　鲶科，俗称黄腾。大者可达5千克以上，常见1千克左右。其肉嫩味美，营养丰富，系鱼中珍品，市价昂贵，习作筵宴佳肴或滋补食物。太平乡九里潭，水深草茂，盛产此鱼。民间有“黄腾煮糟菜——太平名菜”的俗话。现因无节制地捕捞，产量年趋减少。
　　胡子鲶［Clariasfuseus］　属胡子鲶科，俗名塘虱，胸棘有毒腺，生长在暗渠、池塘、水田的静水中。为常见的优良食用鱼，肉多味美，亦可药用。
　　革胡子鲶　为人工饲养鱼，1985年引进试养成功，年产量达4吨。其肉质肥美，市售多从福州、闽清等地贩进，市价合宜，地产个体偏小，与气温有关。
　　福建纹胸鮡［Glgptothoraxfukiensis］　鮡科，俗称菜骨。多见于山涧急流中的小型鱼群。
　　黄鳝［Monopterusalbus］　合鳃科，俗称鳝鱼。生活于稻田、池塘及河沟等处，但数量不多。富含蛋白质，其味甚佳。市售的黄鳝多从江西贩进，颇为畅销。开春时节，“鳝片炒黄瓜”是民间传统的名菜。
　　鲈鱼［Lateolabraxjaponicus］　属鮨科，性凶猛，以鱼、虾等为食。鳍棘有毒，被刺伤者常打寒战，俗称“打鲈鱼寒”。该鱼产卵于闽江入海的河口处，成体栖于闽江中、下游，上游偶见。系境内濒危的珍稀品种。鲈鱼肉质结实，细嫩鲜美，市价昂贵。常作病人术后滋补品，有利于创口愈合。
　　该科常见的还有长体鳜、大眼鳜、暗鳜、白头鳜等4种珍贵的经济鱼类。由于它们形态极似鲈鱼，当地俗称为“鲈鱼”，其实系同科不同属的鱼类。这些鳜鱼常见于市售，渔者用电击滥捕，对资源破坏十分严重。现市面出售的鳜鱼，多是小至50克的鳜鱼，而500克以上者少见。