湄洲湾是福建中部沿海的一个港湾，北邻兴化湾，南邻泉州湾，湾口有湄洲岛作为屏障。湾内三面是大陆环抱；东面是莆田县，西面惠安县，西北是仙游县。湾口朝向东南，湾口以东20海里是乌丘屿。
　　口内有盘屿、大竹岛、小竹岛、大生岛等岛屿自东北向西南分布，把湾口分为4条航道。
　　盘屿西北水道：一般水深都在20米以上，仅进口处螺港礁东侧有浅段，水深6.4～9米，长约1公里。
　　大竹岛北水道：水深一般都在10米以上，局部水深7.8米，长约1公里，万吨级以上船舶由此进港，稍需乘潮。
　　后屿航门与大竹航门：航道的条件较好，一般水深20米左右，大吨位船舶进港均取大竹航门。大竹航道有3段：自大屿(剑屿)灯桩至后屿灯桩，长12000米，宽度600米，水深20米，底质泥，可通航10万吨级船舶。自后屿灯桩至大生岛(小霜屿)长2000米，宽130米，最低潮水深6米，弯道曲率半径1000米，底质泥，乘潮水深12米，持续时间达2小时。在航线右舷仅2链附近(大生岛小霜屿西北方8.5链处)有水深小于2.5米的暗礁；左舷又有水深小于2米的礁脉，航行较危险，吃水较深的船舶(5万吨级以下)应从航线右舷2.5米暗礁东侧通过较为安全。自大生岛(小霜屿)至秀屿长度14000米，宽度800米，水深14米，底质泥，乘潮水深18米，持续时间达4小时，可通10万吨级船舶。
　　湾内潮差较大，平均潮差4.87米，为一隐蔽性和稳定性较好的强潮海湾。湾内有正在建设的秀屿港，西北角有枫亭港区，南岸有肖厝港区。
　　湄洲湾通海航道自剑屿至秀屿，航程29.5公里，至炼油厂码头航程24.3公里，沿程水深分布、海床地质组成以及地貌形态等，差异很大。从剑屿至林齿礁附近，航程约12公里，水深都在20米以上，底质为贝壳砂砾及部分粘土质粉砂，航线较直，水深20米以上的航宽最窄处达1000米，10万吨级大轮无需乘潮通航；从林齿礁至白牛浅滩尾部，航程约6公里，是全航区通航条件最差的航段，根据扫海探测结果，碍航的岸礁自下而上有6处。此外，在大生岛西北有白牛浅滩，其头部切入航槽，成为碍航浅段，最浅处水深5～7米，航线曲折，现只有万吨级以下船舶可不乘潮通航；从白牛浅滩尾到鲤鱼尾长约6.3公里，至秀屿长约11.5公里，在航道附近已无碍航岩礁分布，底质为贝壳砂和粉砂粘土，水深一般都在15米以上，3万吨级以下海轮无需乘潮通航。
　　湄洲湾通海航道自剑屿至秀屿，有剑屿灯桩、黄干岛灯桩、斗尾灯桩、乌矽灯桩、横屿灯桩、龙虎礁灯桩、秀屿灯桩、白礁灯桩、将军屿灯桩9座助航标志。