为建瓯县最大河流，是闽江主要支流，源于浦城和崇安北端，分南浦溪和崇阳溪，两河相汇于徐墩镇山边长源村边，始称建溪。自北向南流经徐墩镇叶坊、徐墩、北津至芝城镇汇入松溪，再经芝城镇七里街、三门和南雅镇白水源、鲁口、太平、白沙、新建、南雅、新村、小雅、房村进入南平市大横，至南平汇入闽江。径流量占闽江水量的1/3。其中境内有5公里以上支流111条；流域面积100平方公里以上的有崇阳溪、南浦溪、松溪、东边溪、小松溪、小桥溪、玉山溪、高阳溪；50平方公里以上的有万石溪、秦溪、延安溪、梅村溪、集瑞溪。
　　崇阳溪　又名西溪，源于崇安县岭阳，流经崇安、建阳县后于徐墩镇丰乐村溪口上游约2公里处入境，自西北向东南流经徐墩镇丰乐、山边，至长源注入建溪。该溪上游落差大，多河曲浅滩，最大流量达4010立方米/秒，为建溪水源的主要补给区。境内有5公里以上支流7条。其中吉阳溪最大，中、下游宽谷河段已建有吉阳镇溪头与小夫水电站。
　　南浦溪　又名浦城溪，源于浦城县七井山，于徐墩镇九匡塘上游1.45公里处入境，自东北向西南流经徐墩镇大潭、湖塘，至长源注入建溪。境内有5公里以上支流3条。流域地带年降水量1700～2200毫米，水量丰富，季节变化小，宜捎排，已建成红湖水轮泵电站。
　　松溪　又名东溪，源于浙江省庆元县力源村，于政和县西津新厂下游100米处入境，自北向南流经川石乡伏寅、慈口、川石、溪口、东游镇渡潭、党城、云头(转西南)、东游、垱上、东峰镇坤口、湍下、井岐、东峰、桂林、杨梅、大房、裴桥、霞镇、铜场、芝城镇东溪口、东溪、南门，至水南桥下游约550米处注入建溪，最大流量5330立方米/秒，枯水期平均流量18.56立方米/秒，最小仅3.9立方米/秒，境内有5公里以上支流47条。其中流域面积100平方公里以上的有后山溪、水源溪、溪屯溪、溪东溪；50平方公里以上有垱阳溪、大源溪、东游溪、溪尾溪、东溪口溪等。
　　小桥溪　又名玉溪，源于玉山镇岭后村的大仙岩，自南而北流至玉山镇陈家山附近转西，流经洋后、下洋、小桥镇张墩、小桥、上堡、阳泽、后塘，至南雅镇白沙注入建溪，为流送木排的主河流，已建成玉山、小桥镇西边、胡台、牛压港、后塘、南雅镇凤墩、玉山镇下洋、上园、洋后水库等100千瓦以上电站9处。有5公里以上支流47条。其中玉山溪为重要支流。
　　小松溪　系小松镇和龙村乡的主河流，源于龙村乡大历的饭甑岗，合流于龙村乡前山，后自东北向西南流经龙村、小汴地、小松镇渔村、小松、李园、定高、湖头、穆墩、上元、芝城镇马汶，至庙下注入建溪，已建成龙村乡际下、岚溪、吴池、小松水库等40千瓦以上电站6处。有5公里以上支流4条。
　　高阳溪　原称房村溪，源于庵基顶南麓，自南向北流经房道镇上庠、七道、山根、顺昌县高阳，至南雅镇仁墩上游3.25公里处入境，于南雅镇房村注入建溪。境内有5公里以上支流10条。