宁化溪河短小湍急，落差大，易涨易退，属山地性河流，自古航运之利很小，历史上境内通航小木船的总里程仅67.6公里，水力资源蕴藏量为9.7万千瓦，可供开发利用之处有262个点，全部开发利用后，装机容量可达3.55万千瓦，年发电量可达1.3万千瓦。
　　绝大部分溪河发源于境内，合流或分流出境，分属闽江、韩江、赣江3个水系，主要属闽江水系。
　　1．闽江水系
　　翠江　　属沙溪支流九龙溪上游，主要支流有东溪、西溪、七里圳溪、石罗坑溪、安乐溪，先后在不同河段汇流出境，境内河长75.1公里，流域面积1622.4平方公里，总落差660米，径流量16.2亿立方米。
　　东溪：为翠江第一大支流，发源于建宁县九县山麓，流经水茜、武昌、溪口至城关合水口与西溪汇合，流域内植被良好，上游水茜溪至溪口与泉湖溪汇合至饭罗墩再与中沙溪汇合。境内河长54.1公里，流域面积818平方公里，总落差636米，年径流量8.25亿立方米。上游有水茜溪、泉湖溪、中沙溪3条支流。水茜溪，即东溪上游九县山至溪口段，境内河长36.8公里，流域面积335.4平方公里，上游有上谢溪、蕉坑溪、沿溪、杨城溪4条支流。泉湖溪，发源于泉上镇联群村，一路纳细流23条，至溪口汇流入东溪主流，河长43.7公里，流域面积273.6平方公里。中沙溪，发源于河龙乡仙山脑山麓，至饭罗墩汇入东溪主流，河长22.8公里，流域面积130平方公里，其上游和中游有雷家坪溪、樟南源溪、叶坊溪3条支流。
　　西溪：为翠江第二大支流，发源于方田泗坑，流经方田、禾磜至禾口纳石碧溪(后称禾口溪)，至陂下纳刘村溪，至分水坳纳辛田溪，一路再纳村头溪、古武溪，经陈岗后纳磜角溪、雷陑溪，至犁嘴上纳武层溪，至城郊合水口与东溪汇合，河长42.5公里，流域面积513平方公里，总落差440米，年径流量5.14亿立方米，流域内植被遭受严重破坏，加上紫色页岩风化强烈，水土流失十分严重，含砂量大，每逢下大雨河水即红浊不堪。主要支流有方田溪、淮土溪、石碧溪、武层溪。方田溪，为西溪上游泗溪至禾口段，一路纳小溪涧5条，河长20.9公里，流域面积80平方公里。淮土溪，发源于方田乡的岭下，至吴陂纳罗坑溪，至石碧与石碧溪汇合，河长20公里，流域面积62平方公里。石碧溪，发源于东华山麓，至禾口汇入禾口溪，河长20公里，流域面积58平方公里。武层溪，发源于长坊，一路纳小溪6条，至犁嘴上汇入西溪主流，河长31.6公里，流域面积109.3平方公里。
　　东溪、西溪在合水口汇合后，称翠江，至江背纳七里圳溪，至麦堰纳石罗坑溪，至水口纳各溪，至埔上纳安乐溪，经萧家入清流县境，自合水口至萧家一段全长21公里。
　　安远溪　　发源于牛牯□山麓，流域内森林植被较好，属多雨区。因安远受福建嶂和桃丰山阻隔，在安远境内自成水系，3条支流在安远附近汇流后经永跃村向东北流入建宁县的宁溪，经金溪、富屯溪汇流入闽江，为闽江水系三级支流宁溪的上游，境内河长27.7公里，流域面积321.5平方公里。
　　罗溪(亦称曹坊溪)　　发源于曹坊乡的官地，经长汀边界入清流罗口溪，至秋口汇入九龙溪，属闽江水系第四级支流，境内河长13.6公里，流域面积49平方公里，总落差720米，年径流量0.51亿立方米。
　　治平溪　　发源于高地，先后共纳小溪涧10条，经桂口井入长汀境，与罗溪汇流入罗口溪，属闽江水系第四级支流，境内河长32.5公里，流域面积126.5平方公里，总落差770米，年径流量1.74亿立方米。
　　除以上4条溪河外，尚有属闽江水系的11条小溪独流出境，分别流入罗口溪、九龙溪、枫溪、盖洋溪、嵩溪、宁溪。
　　2．韩江水系(境内属韩江水系的溪河有下坪溪和叶公岭溪)
　　下坪溪(又名奄香溪)　　发源于治平乡赖家山，至沙罗排纳桥下溪入汀江，汇入广东韩江，流域内森林茂密，水质清澈，境内河长13.5公里，流域面积41.2平方公里，总落差801米，年径流量0.43亿立方米。
　　叶公岭溪　　发源于治平乡田畲村的杨梅岭下，由叶公岭出境。境内河长3.6公里，流域面积8.7平方公里。
　　3．赣江水系(主要有横江溪和米子迳溪)
　　横江溪　　发源于治平乡高地村各溪里，流经桥下水库沿宁化、石城边界至淮土乡五星村米子迳附近出境，属赣江支流琴江的上游，境内河长14.5公里，流域面积43.1平方公里，总落差605米，年径流量0.44亿立方米。
　　米子迳溪　　发源于淮土乡五星村的塘家山，至米子迳附近出境后汇入横江溪，境内河长7.4公里，流域面积10.1公里，总落差325米。
　　除以上2条溪以外，属赣江水系的还有4条小溪，其中淮土3条，济村1条，分别独流出境，入横江或白沙水，汇入琴江。