境内溪流有18条，多属穆阳溪、霍童溪上游。属穆阳溪的有龙亭溪、八蒲溪、三门桥溪、际溪，流域总面积为625平方公里。属霍童溪水系的有后垄溪、桃源溪，流域总面积为386.5平方公里。另由纯池出境经寿宁斜滩溪汇入福安交溪的有徐柏溪，流域面积为34.5平方公里。流域面积在50平方公里以上的溪流有8条，溪流长度15至84公里，落差182～1025米。全县水能理论蕴藏量为26.93万千瓦，可开发电力37.46万千瓦。
　　龙亭溪　系县内最大溪流，是穆阳溪的主干流，上接政和榅洋溪。发源于政和县半源的黄华坑，在东兴农场附近入境，经榅树林、溪口、那坑、龙亭、进登、大前坪、黄县(闽东电站水坝)到文潭，下接穆阳溪。其中，泗桥乡芹山瓦窑仔山西部以上为周宁、政和界河，狮城镇大前坪至七步乡文潭村石门头山东部为周宁、福安界河。境内长56公里，流域面积483.7平方公里，落差616米，平均比降11‰。水能理论蕴藏量达13.79万千瓦。注入龙亭溪的有泗桥溪、前溪、禾溪、纯池溪、七步溪等支流。
　　七步溪　系龙亭溪的主要支流。发源于圣银楼山麓经李墩、七步、九龙漈、汇入龙亭溪，其上游称李墩溪。全长34公里，流域面积155.6平方公里。落差1025米，平均比降30‰。水能理论蕴藏量为2.99万千瓦。注入七步溪的支流有东洋溪、祭坪溪等。
　　东洋溪　系七步溪支流，因所处地名原称“东洋”，故名东洋溪。发源于浦源乡源头村，经溪坪、端源、狮城镇、纳诸小涧过鼓音漈汇入七步溪。全长18公里，流域面积为51.1平方公里，平均比降16.3‰。水能理论蕴藏量0.45万千瓦。
　　八蒲溪　系穆阳溪支流。发源于小郭洋的仙冈头，经后洋、八蒲出境，过福安县的象地、牛岭尾汇入穆阳溪。境内长15.1公里，流域面积为49.3平方公里，平均比降32.4‰。水能理论蕴藏量0.65万千瓦。
　　后垅溪　发源于政和县杨源乡的乌际，由礼门乡香炉山西麓入境，经叉溪、后垅、樟冈出境，过宁德莒洲，复入咸村乡富濑村，流入霍童溪。其中后垅村以上为周宁、屏南县界河，有闻名的鸳鸯和猕猴自然保护区；富濑村段为周宁、宁德两县界河。全长53.3公里，流域面积534.5平方公里。其中：县境内长26公里，流域面积227.5平方公里，平均比降7‰，水能理论蕴藏量4.92万千瓦。注入后垅溪的有芹溪、吾东溪等支流。
　　芹溪　系后垅溪支流。发源于圣银楼山麓，经常源、楼下冈汇入后垅溪。全长14.9公里，流域面积64.6平方公里，平均比降27.2‰。水能理论蕴藏量0.42万千瓦。
　　吾东溪　原名五丈溪，系后垅溪支流，因过吾东溪村而改名。发源于礼门乡的南主岩，流经贡川、际会、吾东溪、家潭头汇入后垅溪。全长22.1公里，流域面积72.4平方公里，平均比降35.7‰。水能理论蕴藏量1.38万千瓦。
　　桃源溪　系霍童溪支流，因流经“桃源”而得名。发源于七步乡菩萨顶山麓，流经车盘、际岩里、咸村，至街头亭出境，汇入霍童溪。全长16.6公里，流域面积159平方公里，平均比降39.3‰。水能理论蕴藏量0.344万千瓦。注入桃源溪的有川中溪等支流。
　　川中溪　系桃源溪支流。发源于方广寺附近，经长峰、赤洋、川中至里兰山汇入桃源溪。汇入川中溪的有下坑溪及玛坑杉洋诸涧。全长20.4公里，流域面积78.4平方公里，平均比降18.3‰。水能理论蕴藏量0.3万千瓦。