古田溪位于闽江中游北岸，发源于屏南县鹫峰山东南部，流经富洋溪、官洋溪、剑溪、古溪入闽江，总长106公里，境内通航52公里。
　　富洋溪航道　位于古田溪上游的屏南县长桥至境内平湖河段，长25公里，境内通航20公里，河宽50～80米，河道多险滩乱石，比降幅度大，最浅处水深0.2米，难以通航。民国33年(1944年)8月，屏南与古田两县政府磋商，由两县士绅筹资整治该河道，清除松毛林、猴啼壑、犁壁港、土砻耙等滩礁30多处，是年11月通小雀船(翘尾船)，至1958年，因公路建成而废止。
　　官洋溪航道　位于古田溪中上游，自新舫至旧城北门船头站，通航20公里，河宽60～100米，最浅水深为0.34米，水流平缓，河床多为岩石结构，途经厘利、厘龙头顶和下甲3处险滩，最长处达60米，航道宽仅2米，最浅水深0.5米，比降大、水流急。清代始有小木船运货，年均货运量达0.25吨，周转量为5万吨公里，航运业务经久不衰。至1959年6月，古田水库建成后，水位升高，原航道消失。
　　剑溪航道　位于古田溪中游，船头站至旧城六保尾，通航6公里，其中溪山至五保鲤鱼坂河宽200米，水深1米以上，水流平缓。宋代已有“渔舟往来”，向为城区客货水运的主航道。1959年，该航道被古田水库淹没。
　　古溪航道　位于古田溪下游，起自六保尾至水口，经闽清县桔林乡等地，入境内水口，流入闽江。河床岩石结构，溪流弯曲窄小，比降大，水流急，只有境内时坪至水口6公里可通航。